qPCR實驗的注意事項有哪些

　　q是指在PCR體系中加入熒光染料或熒光探針，利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程，通過C-值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。那么你知道qPCR實驗的注意事項有哪些嗎？讓我們一起來看看吧！
 

　　一、模板制備
 

　　在進(jìn)行qPCR實驗時，需要根據(jù)所用試劑盒說明書加入適量的起始核酸模板，過多的模板可能提高污染物含量，大大降低 PCR 效率，過少的模板可能會降低檢測靈敏性和重復(fù)性。
 

　　根據(jù)檢測靶標(biāo)的性質(zhì)特點，選擇合適的核酸抽提試劑盒同樣至關(guān)重要。小編有遇到老師想要通過qPCR的方法完成對microRNA的定量，但是發(fā)現(xiàn)待檢測樣本中目標(biāo)microRNA和內(nèi)參基因的擴(kuò)增曲線出峰時間都比較晚，內(nèi)參基因的Ct值甚至大于30(圖2)。排除實驗操作問題后發(fā)現(xiàn)原來是因為所使用RNA抽提試劑盒對小片段的microRNA回收效率低，不適合用于下游microRNA定量實驗。
 

　　二、引物探針的設(shè)計及儲存
 

　　除了要保證模板的質(zhì)量外，引物探針的設(shè)計和穩(wěn)定性同樣至關(guān)重要。當(dāng)我們根據(jù)檢測靶標(biāo)設(shè)計特異性引物和探針時，除了要考慮片段長度，Tm值，堿基組成等基本要點外，還需格外注意引物，探針自身不能形成復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu)，上下游引物內(nèi)部，引物探針之間不能出現(xiàn)結(jié)合的現(xiàn)象，因為這些都可能影響引物探針與目標(biāo)基因的結(jié)合，進(jìn)而影響擴(kuò)增效率。
 

　　除了引物探針在設(shè)計時需要格外花費心思外，收到合成好的引物、探針如何稀釋，如何保存同樣有小tips。如果我們合成的引物探針是干粉狀或是需要稀釋時，為了保證引物探針的穩(wěn)定性建議用1×TE buffer去溶解和稀釋。另外，引物的儲存濃度也可能影響其穩(wěn)定性，建議引物的儲存濃度不低于 10 μM，一般為100 μM 。此外如果引物和探針每次使用量較少時，還應(yīng)該進(jìn)行分裝，保存在-20℃，以減少反復(fù)凍融的次數(shù)。
 

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